全基因組甲基化測序
技術簡介
DNA 甲基化是一種非常重要的表觀遺傳修飾方式，在維持正常細胞功能、遺傳印記、胚胎發(fā)育以及人類腫瘤發(fā)生中起著重要的作用。全基因組甲基化測序 (Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS) 是將重亞硫酸氫鹽處理方法與高通量測序平臺相結合，對有參考基因組物種的DNA 甲基化狀態(tài)進行全基因組范圍內檢測，為眾多生物學過程、人類健康與疾病的表觀遺傳機制研究提供強有力的技術手段。
技術路線
送樣建議
濃度(Qubit) | 體積 | 總量 | 基因組完整性 |
≥15ng/μL | ≥50 μL | >100 ng | DNA無明顯降解，無雜質污染 |
技術參數(shù)
| 全基因組甲基化測序 | 測序策略 | 數(shù)據(jù)量 | 周期 |
HiSeq2500/4000，PE150 | 30X | 50個工作日起 |
案例分析
單細胞WGBS 揭示細胞分化過程中的表觀遺傳調控[1]
研究背景
單細胞基因組測序和轉錄組測序熱潮技術加深了我們對細胞異質性研究的認識，然而單細胞表觀基因組的研究我們卻知之甚少。
研究目的
本研究證實WGBS技術在小細胞群（μWGBS）和單細胞（scWGBS）異質性表觀遺傳學研究中的應用的可行性，并且提供新的分析思路，為單細胞甲基化研究打下堅實基礎。
研究結果
通過對人和小鼠體內單細胞進行WGBS研究，揭示細胞分化的異質性和表觀遺傳修飾的相關性，并首次繪制人體細胞scWGBS的甲基化譜。
單細胞WGBS技術流程圖
參考文獻
[1]. Farlik, M. et al. Single-cell DNA methylome Sequencing and bioinformatic inference of epigenomic cell-state dynamics. Cell Rep , 2015, 10:1386-1397,doi:10.1016/j.celrep.2015.02.001 .
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